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根据2013年9月由中国科学技术信息研究所、北京万方数据股份有限公司公布的《2013版中国科技期刊引证报告（扩刊版）》，2012年《水产科学》期刊影响因子等各项指标同比均有所上升。2012年《水产科学》影响因子达到0.770；总被引频次为1426；引用刊数为301；他引率为0.95。