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根据2016年10月由北京万方数据股份有限公司公布的《2016年版中国科技期刊引证报告（扩刊版）》显示，2015年《水产科学》期刊影响因子等各项指标同比均有所上升，最新影响因子0.970，同比提升7.66%，创历史新高，位列全部27种水产类期刊第5位；总被引频次2092次，同比增长10.92%，仅次于《水产学报》和《中国水产科学》，位列水产类期刊第3位；引用刊数335种，同比增加4.69%，仅次于《水产学报》和《上海海洋大学学报》，位列水产类期刊第3位；他引率0.91。